Gracias por tu respuesta jcaro,

... de hecho no tengo nada realizado aun, apenas me estoy iniciando en Java, he hecho aplicaciones en PHP y MySQL pero nada en Java, ¿como me puedes ayudar? ¿quieres que te mande el archivo .jar para que le heches un vistazo? he pensado que lo que se necesita es hacer una base de datos en MySQL donde pueda manipularla mediante una interfaz hecha en PHP y la aplicacion en Java mande llamar a la base de datos para que haga la actualizacion sin necesidad de hacer un reload, o por lo menos que no se note cuando la pagina se actualiza, que solo se actualicen los numeros que estoy cambiando... ¿sera correcto? o ¿que forma crees que sea conveniente?

Gracias por tu ayuda.