para los scripts puedes utilizar
Codigo:
<script type="text/javascript"></script>
para las nuevas ventanas hay un truco que debes hacer con javascript
Codigo:
<a onclick="window.open(this.href,'_blank');return false;" href="http://sitio.com">Link para nueva ventana</a>
pero abrir links en nuevas ventanas se me hace de super mal gusto... creo que eso debería ser opción del visitante y no forzarlos a que abran una nueva ventana para cada link que presionen